MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	ATTC	2	8	431	438	25 %	50 %	0 %	25 %	258509941
2	NC_013200	TTC	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509941
3	NC_013200	CT	3	6	576	581	0 %	50 %	0 %	50 %	258509941
4	NC_013200	AAC	2	6	586	591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
5	NC_013200	AGC	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509941
6	NC_013200	TGC	2	6	846	851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509941
7	NC_013200	GC	3	6	850	855	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
8	NC_013200	TGC	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509941
9	NC_013200	GC	3	6	904	909	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
10	NC_013200	ATA	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509941
11	NC_013200	CTA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509941
12	NC_013200	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509941
13	NC_013200	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509941
14	NC_013200	ACG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509941
15	NC_013200	GAT	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509941
16	NC_013200	CAA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
17	NC_013200	TTC	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509941
18	NC_013200	A	7	7	1366	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	258509941
19	NC_013200	AAC	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
20	NC_013200	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509941
21	NC_013200	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509941
22	NC_013200	TGA	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
23	NC_013200	A	6	6	1632	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	258509942
24	NC_013200	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509942
25	NC_013200	CGTCA	2	10	1757	1766	20 %	20 %	20 %	40 %	258509942
26	NC_013200	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
27	NC_013200	CGAC	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	258509942
28	NC_013200	TGA	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
29	NC_013200	AGA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509942
30	NC_013200	AGC	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509943
31	NC_013200	ACA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509943
32	NC_013200	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509943
33	NC_013200	ATA	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509943
34	NC_013200	TAA	2	6	2599	2604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509943
35	NC_013200	GCT	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509943
36	NC_013200	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509943
37	NC_013200	AC	3	6	2866	2871	50 %	0 %	0 %	50 %	258509943
38	NC_013200	GTG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509943
39	NC_013200	AGC	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509943
40	NC_013200	GCTG	2	8	3190	3197	0 %	25 %	50 %	25 %	258509943
41	NC_013200	ATG	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
42	NC_013200	CAA	2	6	3290	3295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509944
43	NC_013200	CAATTT	2	12	3297	3308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258509944
44	NC_013200	CGC	2	6	3335	3340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509944
45	NC_013200	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509944
46	NC_013200	TGA	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
47	NC_013200	TTA	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509944
48	NC_013200	TTGT	2	8	3510	3517	0 %	75 %	25 %	0 %	258509944
49	NC_013200	A	6	6	3531	3536	100 %	0 %	0 %	0 %	258509944
50	NC_013200	GATT	2	8	3560	3567	25 %	50 %	25 %	0 %	258509944
51	NC_013200	AAG	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509944
52	NC_013200	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509944
53	NC_013200	ATG	2	6	3801	3806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
54	NC_013200	ACAAG	2	10	3824	3833	60 %	0 %	20 %	20 %	258509944
55	NC_013200	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509944
56	NC_013200	AGT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509945
57	NC_013200	ATC	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509945
58	NC_013200	CAA	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509946
59	NC_013200	GATT	2	8	4727	4734	25 %	50 %	25 %	0 %	258509946
60	NC_013200	T	7	7	4733	4739	0 %	100 %	0 %	0 %	258509947
61	NC_013200	CAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509947
62	NC_013200	GAT	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509947
63	NC_013200	TCAT	2	8	4844	4851	25 %	50 %	0 %	25 %	258509947
64	NC_013200	ATC	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509947
65	NC_013200	TTG	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509947
66	NC_013200	AGG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509947
67	NC_013200	AT	3	6	5062	5067	50 %	50 %	0 %	0 %	258509948
68	NC_013200	TGC	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509948
69	NC_013200	CAA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
70	NC_013200	CAA	3	9	5153	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
71	NC_013200	AAC	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
72	NC_013200	AAAG	2	8	5212	5219	75 %	0 %	25 %	0 %	258509948
73	NC_013200	TGAC	2	8	5226	5233	25 %	25 %	25 %	25 %	258509948
74	NC_013200	TTG	2	6	5240	5245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509948
75	NC_013200	GTC	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509948
76	NC_013200	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
77	NC_013200	GGT	3	9	5408	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509948
78	NC_013200	AAG	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
79	NC_013200	CAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
80	NC_013200	ATC	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
81	NC_013200	TCAG	2	8	5693	5700	25 %	25 %	25 %	25 %	258509949
82	NC_013200	CTG	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509949
83	NC_013200	ACA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
84	NC_013200	AAG	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
85	NC_013200	TCA	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
86	NC_013200	AGC	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509949
87	NC_013200	ACA	3	9	6217	6225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
88	NC_013200	GAG	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509949
89	NC_013200	ACT	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
90	NC_013200	AAG	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
91	NC_013200	AT	3	6	6451	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	258509949
92	NC_013200	TACCG	2	10	6462	6471	20 %	20 %	20 %	40 %	258509949
93	NC_013200	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
94	NC_013200	CAT	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
95	NC_013200	AAG	3	9	6630	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
96	NC_013200	CAG	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509949
97	NC_013200	CAAC	2	8	6797	6804	50 %	0 %	0 %	50 %	258509950
98	NC_013200	CCA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509950
99	NC_013200	GCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509950
100	NC_013200	GAG	2	6	6923	6928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509950
101	NC_013200	GC	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
102	NC_013200	TCCG	2	8	7074	7081	0 %	25 %	25 %	50 %	258509951
103	NC_013200	GCA	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
104	NC_013200	GTC	2	6	7156	7161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509951
105	NC_013200	AAG	2	6	7209	7214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
106	NC_013200	AGA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
107	NC_013200	TTG	2	6	7264	7269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509951
108	NC_013200	GTCA	2	8	7296	7303	25 %	25 %	25 %	25 %	258509951
109	NC_013200	TTA	2	6	7339	7344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509951
110	NC_013200	TCA	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
111	NC_013200	TGA	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509951
112	NC_013200	TTTC	2	8	7466	7473	0 %	75 %	0 %	25 %	258509951
113	NC_013200	AAG	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
114	NC_013200	ACT	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
115	NC_013200	GCG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509951
116	NC_013200	AACA	2	8	7849	7856	75 %	0 %	0 %	25 %	258509951
117	NC_013200	CG	4	8	7908	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
118	NC_013200	AGG	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509951
119	NC_013200	TAC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
120	NC_013200	A	6	6	8021	8026	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
121	NC_013200	ATGGAA	2	12	8033	8044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258509951
122	NC_013200	GGT	3	9	8058	8066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509951
123	NC_013200	CCA	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509951
124	NC_013200	AGC	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
125	NC_013200	ACT	2	6	8188	8193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
126	NC_013200	A	7	7	8410	8416	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
127	NC_013200	CGC	2	6	8420	8425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509951
128	NC_013200	ACA	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509951
129	NC_013200	GTG	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509951
130	NC_013200	TCA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
131	NC_013200	AGC	2	6	8795	8800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
132	NC_013200	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	258509951
133	NC_013200	CAA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509951
134	NC_013200	CAG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
135	NC_013200	AGC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
136	NC_013200	AACT	2	8	8942	8949	50 %	25 %	0 %	25 %	258509951
137	NC_013200	TCA	2	6	8986	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
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139	NC_013200	TAC	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
140	NC_013200	TTC	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509951
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142	NC_013200	CAG	2	6	9207	9212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
143	NC_013200	TCG	2	6	9227	9232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509951
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148	NC_013200	CAG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
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166	NC_013200	GTGA	2	8	11172	11179	25 %	25 %	50 %	0 %	258509955
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261	NC_013200	TTA	2	6	18220	18225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509964
262	NC_013200	GTG	2	6	18239	18244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509964
263	NC_013200	TCGAA	2	10	18246	18255	40 %	20 %	20 %	20 %	258509964
264	NC_013200	GAG	2	6	18259	18264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509964
265	NC_013200	AAG	2	6	18268	18273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509964
266	NC_013200	ATCA	2	8	18329	18336	50 %	25 %	0 %	25 %	258509964
267	NC_013200	CTG	2	6	18350	18355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509964
268	NC_013200	CGT	2	6	18393	18398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509964
269	NC_013200	ATG	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
270	NC_013200	GAAC	2	8	18561	18568	50 %	0 %	25 %	25 %	258509964
271	NC_013200	TGA	2	6	18630	18635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
272	NC_013200	GCA	2	6	18667	18672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509964
273	NC_013200	CTT	2	6	18739	18744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509964
274	NC_013200	GCAG	2	8	18795	18802	25 %	0 %	50 %	25 %	258509964
275	NC_013200	TGA	2	6	18882	18887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
276	NC_013200	TGA	2	6	18903	18908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
277	NC_013200	AATG	2	8	18933	18940	50 %	25 %	25 %	0 %	258509964
278	NC_013200	ATG	3	9	18938	18946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
279	NC_013200	AG	3	6	19007	19012	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
280	NC_013200	CGC	2	6	19017	19022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509964
281	NC_013200	TGTA	2	8	19026	19033	25 %	50 %	25 %	0 %	258509964
282	NC_013200	CTG	2	6	19057	19062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509964
283	NC_013200	CG	3	6	19065	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	258509964
284	NC_013200	AT	3	6	19091	19096	50 %	50 %	0 %	0 %	258509964
285	NC_013200	TGA	2	6	19217	19222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
286	NC_013200	AAC	2	6	19279	19284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509964
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288	NC_013200	GA	3	6	19436	19441	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
289	NC_013200	GCAATT	2	12	19510	19521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258509964
290	NC_013200	AGT	2	6	19566	19571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
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293	NC_013200	ATAG	2	8	19612	19619	50 %	25 %	25 %	0 %	258509964
294	NC_013200	TGA	2	6	19626	19631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509964
295	NC_013200	A	6	6	19690	19695	100 %	0 %	0 %	0 %	258509964
296	NC_013200	AAT	2	6	19727	19732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509964
297	NC_013200	CAAG	2	8	19844	19851	50 %	0 %	25 %	25 %	258509965
298	NC_013200	AAC	2	6	19889	19894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509965
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300	NC_013200	GAT	3	9	20100	20108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509965
301	NC_013200	GAG	2	6	20167	20172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509965
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303	NC_013200	AAG	2	6	20269	20274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509966
304	NC_013200	GAAA	2	8	20411	20418	75 %	0 %	25 %	0 %	258509966
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389	NC_013200	TGAAT	2	10	25055	25064	40 %	40 %	20 %	0 %	258509969
390	NC_013200	CGT	2	6	25100	25105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509969
391	NC_013200	AGC	2	6	25153	25158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509969
392	NC_013200	ATT	2	6	25188	25193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509969
393	NC_013200	CTG	2	6	25452	25457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509970
394	NC_013200	CGT	2	6	25580	25585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509970
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407	NC_013200	CAA	2	6	26428	26433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509973
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423	NC_013200	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
424	NC_013200	TCT	2	6	27355	27360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509975
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430	NC_013200	AATA	2	8	27916	27923	75 %	25 %	0 %	0 %	258509976
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